Los dos tercios se fusionan en uno mandado por Alonso de Navarrete, quedando activos otros 16 capitanes. Pese a las gestiones de la duquesa, los estados generales se niegan a aportar el dinero necesario para pagarlos y exigen su retirada. Margarita tiene que pagarles de su propio bolsillo, debiendo solicitar créditos para ello. Elevada consulta El 4 de octubre Margarita escribe al reyque las quejas de la población contra los desmanes de la tropa española han conducido a una situación insostenible, este y que tienen que salir inmediatamente de Flandes. Este envía el dinero necesario y ordena que el tercio parta hacia Flesinga (Zelanda), donde es embarcado en octubre a la espera de un viento propicio para zarpar. Allí  Poco después, las cartas de Granvela advierten al rey de su error, por lo que este ordena a Margarita que contemporice. En carta del 15 de octubre de 1560, ella le contesta que las ciudades se niegan a pagar sus impuestos mientras los extranjeros no salgan del país y que, de producirse una revuelta general, esos 3.000 españoles no bastarían para sofocarla. El 12 de diciembre el rey accede a que el tercio de los españoles se haga a la mar, ya que así podrá emplear sus pagas en levantar nuevas tropas en Italia, muy mermadas tras la derrota de los Gelves. También ordena que, una vez en tierras españolas, las compañías partan deshiladas a Nápoles o Sicilia, responsabilizándose sus maestres de campo de la disciplina general. Justo antes de la partida, muere Navarretey todas las compañías quedan a cargo de Alonso de Cáceres.