| [[File:Caballo de Lascaux.jpg|center|thumb|<center>Caballo de Lascaux</center>]]

| [[File:Caballo de Przewalski.jpg|center|thumb|<center>Caballo de Przewalski</center>]]

La biología molecular ha permitido a los veterinarios estudiar el funcionamiento de la genética del [[caballo]] para comprender cómo se producen las capas de las diferentes razas. El fenotipo es el color que muestra el animal y está determinado por su genotipo, es decir, el conjunto de genes que aporta cada progenitor. Un gen recesivo necesita que sea aportado por ambos progenitores (se escribe en minúscula), mientras que en un gen dominante basta con que lo aporte uno de ellos (letra mayúscula). Si un [[caballo]] lleva el mismo gen en ambos alelos, se denomina homocigótico (X/X, x/x) y si lo lleva diferente (X/x, x/X), heterocigótico. Así, por ejemplo:

===Capas básicas===

Las dos primeras capas se deben a la presencia o ausencia del gen "extensión" (''E: Extension''):

* Negro (''black''): cuerpo y crines de color negro azabache, ojos marrones oscuros (E/E, E/e).

El gen "agoutí" (''A: Agouti'') reduce la eumelanina a las crines, cola, patas y orejas. Su presencia produce una tercera capa:

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===Dilución parda===

El gen "pardo" (''D: Dun'') diluye el pelo de todo el cuerpo y provoca raya de mulo en el lomo, vientre claro y, a veces, cebraduras en las patas, de ahí que se le conozca como ''gen primitivo''. Dependiendo del color base, se distinguen tres nuevas capas:

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===Dilución crema===

* Negro:

** Negro ahumado (''smoky black''): cuerpo negro o marrón, crines negras o castañas, ojos marrones claros.

* Castaño:

* Alazán:

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===Dilución champán===

La dilución "champán" (''Ch: Champagne'') afecta tanto al pelo del cuerpo como a las crines. Produce un tono uniforme con aspecto metálico, hocico claro y ojos azules al nacimiento, que se vuelven marrón claro con la edad. Produce tres variantes:

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Los caballos plateados homocigóticos (ZZ) pueden sufrir enfermedades oculares.

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===Capa blanca===

* Tordo vinoso (''rose gray''): el encanecimiento incipiente produce unos manchas circulares sobre el lomo y las ancas de un tono más clara que el resto.

* Tordo rodado (''dappled gray''): se invierte la proporción de colores y ahora el blanco predomina sobre los rodales negros.

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===Capa ruana===

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===Notas===

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